颜思 齐见岛上地肥水美、大片荒野未辟，大为兴奋，决意在此开疆拓土，干一番事业。
于是，他率众伐木辟土，构筑寮寨，后又不断从大陆招纳漳、泉移民在此拓荒垦殖，主要种植大米、麻，以及蔗糖等农作物。
第二年九月，颜思 齐在诸罗山行猎的时候，据说因为感冒死在了当地，年仅二十一岁的郑芝龙继承了颜思 齐的首领地位，得到了颜思 齐的大部分遗产。
不过，郑芝龙继承了首领地位后，并没有在大员的拓展垦殖上下很大的力气，以致荷兰人在大员的势力扩展很快，加上西班牙人也来插了一脚，导致大员的局面变得复杂。
而郑芝龙当时正忙着同各大海上势力不断交战，争夺海上霸权，不愿意多蹚浑水，一度决定放弃在大员的移民据点，撤回福建。
后来，由于一件事，他才放弃了这一念头，改为继续经营大员。